Każdy system komputerowy musi być odpowiednio zabezpieczony. Każdy moduł jest wystawiony na wiele niebezpieczeństw. Przed analizą systemów rozproszonych i przemysłowych, należy najpierw spojrzeć na wszystkie moduły z osobna. Systemy rozproszone są z reguły dużymi strukturami. Konfiguracja i wszystkie wdrożenia mogą być kłopotliwe, ponieważ elementy całej instalacji są od siebie odległe.
Podstawowymi problemami i niebezpieczeństwami są protokoły komunikacyjne, które łącza wszystkie moduły systemu. Trzeba też zwrócić uwagę na ataki terrorystyczne, sabotaże, bunty oraz strajki.
Pomijając te aspekty, analiza bezpieczeństwa rozproszonego systemu przemysłowego niewiele różni się od bezpieczeństwa zwykłego systemu scentralizowanego. David Geer w artykule dla computer.org przedstawił wygląd typowego, rozproszonego systemu kontroli.